Microarray & SNPs

ApoE

rs429358 + rs7412

APOE kodiert ein Transportprotein für Cholesterin und andere Lipide. Zwei SNPs bestimmen die häufigen Isoformen ε2, ε3 und ε4. ε4 ist mit einem höheren Alzheimer-Risiko verbunden; ε2 meist mit einem niedrigeren. Stärke und Bedeutung dieser Zusammenhänge hängen unter anderem von Alter, Geschlecht und Abstammung ab. Der Genotyp allein sagt nicht voraus, ob oder wann jemand erkrankt.

Kernpunkte

  • ε4 ist mit höherem durchschnittlichem Risiko verbunden; zwei Kopien verändern die Einordnung zusätzlich.
  • ε2 wirkt protektiv für Alzheimer, ist aber mit Typ-III-Hyperlipoproteinämie assoziiert.
  • Penetranz ist unvollständig: viele ε4-Träger erkranken nie, viele Erkrankte tragen kein ε4.
ApoE · ISOFORM AUS ZWEI SNPsApoE ε2rs429358T · Cys112rs7412T · Cys158Alzheimer-Risiko ↓selten, Lipid-Hinweis möglichApoE ε3rs429358T · Cys112rs7412C · Arg158Referenzhäufigste VarianteApoE ε4rs429358C · Arg112rs7412C · Arg158Alzheimer-Risiko ↑dosisabhängig, kein SchicksalJeder Mensch trägt zwei ε-Allele (z. B. ε3/ε4). Die Kombination zählt, nicht ein einzelner SNP.

Die drei Isoformen aus zwei SNPs

Die Isoform wird durch zwei Aminosäurepositionen festgelegt: 112 (rs429358) und 158 (rs7412). ε3, die häufigste Form, trägt Cystein an 112 und Arginin an 158. ε4 entsteht, wenn rs429358 das C-Allel trägt (Arginin an 112). ε2 entsteht, wenn rs7412 das T-Allel trägt (Cystein an 158). Erst beide SNPs zusammen ergeben die ε-Kombination.

Was das Risiko bedeutet

ε4 ist in vielen Populationen mit einem höheren durchschnittlichen Alzheimer-Risiko verbunden; die Stärke der Assoziation unterscheidet sich jedoch nach Abstammung, Alter und Geschlecht. Relative Gruppenwerte lassen sich nicht direkt in die persönliche Wahrscheinlichkeit oder einen Erkrankungszeitpunkt umrechnen. Für eine individuelle Einordnung wären weitere Faktoren nötig, und auch dann bleibt eine Prognose unsicher.

Vorsicht bei der Deutung

Ein APOE-Ergebnis kann persönliche Fragen aufwerfen. Der Genotyp allein legt keine Vorsorge, Behandlung oder andere Maßnahme fest. Genome zeigt die technische Variante und ersetzt weder die Bestätigung durch ein geeignetes klinisches Verfahren noch eine genetische Beratung.

Was Genome misst. Die Genotypen an rs429358 und rs7412, aus denen sich die ε-Isoform-Kombination ableitet (zum Beispiel ε3/ε4).

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Quellen

  1. 1Corder et al., 1993 Gene dose of apolipoprotein E type 4 allele and the risk of Alzheimer's disease in late onset families. Science 261:921-923. doi.org/10.1126/science.8346443
  2. 2Liu et al., 2013 Apolipoprotein E and Alzheimer disease: risk, mechanisms and therapy. Nature Reviews Neurology 9:106-118. doi.org/10.1038/nrneurol.2012.263