ApoE
rs429358 + rs7412
APOE kodiert ein Transportprotein für Cholesterin und andere Lipide. Zwei SNPs definieren die drei Isoformen ε2, ε3 und ε4. Die ε4-Form erhöht das Risiko für Alzheimer und Herz-Kreislauf-Erkrankungen, die ε2-Form senkt das Alzheimer-Risiko. Es ist ein Risikomarker, kein Schicksal.
Die drei Isoformen aus zwei SNPs
Die Isoform wird durch zwei Aminosäurepositionen festgelegt: 112 (rs429358) und 158 (rs7412). ε3, die häufigste Form, trägt Cystein an 112 und Arginin an 158. ε4 entsteht, wenn rs429358 das C-Allel trägt (Arginin an 112). ε2 entsteht, wenn rs7412 das T-Allel trägt (Cystein an 158). Erst beide SNPs zusammen ergeben die ε-Kombination.
Was das Risiko bedeutet
In europäischstämmigen Kohorten geht ein ε4-Allel mit einem etwa drei- bis vierfachen, zwei ε4-Allele mit einem rund zehn- bis fünfzehnfachen Alzheimer-Risiko einher, jeweils relativ zu ε3/ε3. Das ist ein erhöhtes Risiko, keine Diagnose: Alter, Lebensstil, Geschlecht und weitere Gene verschieben das Bild stark. ε4 erhöht zudem tendenziell das LDL-Cholesterin.
Vorsicht bei der Deutung
Der ε4-Status kann belasten, ohne eine Handlungsoption zu eröffnen, solange keine wirksame Prävention etabliert ist. Genome stellt nur den technischen Genotyp dar. Wer den eigenen Status erfährt, sollte das im Zusammenhang und idealerweise mit Beratung tun.
Was Genome misst. Die Genotypen an rs429358 und rs7412, aus denen sich die ε-Isoform-Kombination ableitet (zum Beispiel ε3/ε4).
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Quellen
- 1Corder et al., 1993 Gene dose of apolipoprotein E type 4 allele and the risk of Alzheimer's disease in late onset families. Science 261:921–923. doi.org/10.1126/science.8346443
- 2Liu et al., 2013 Apolipoprotein E and Alzheimer disease: risk, mechanisms and therapy. Nature Reviews Neurology 9:106–118. doi.org/10.1038/nrneurol.2012.263